The influence of protonation and deprotonation, on the acidic-basic properties of purine, pyrimidine and imidazole .
Abstract
Напівемпіричним квантов о хімічним методом AMI в режимі оптимізацй всіх структурних параметрів з нормою градієнта < 0,01 розраховано енергії протонування та депротонування електрично нейтральної, протонованих (катіонних) і депротонованих (аніонних) форм пурину (Pur), піримідину (Рут) та імідазолу (Іт) у вільному стані, а також заряди на атомах для всіх цих форм. Встановлено, що зміна зарядового стану молекули шляхом протонування чи депротонування радикально змінює її кислотно- лужні властивості. Так, протонування Риг, Руг та Im, зводячи нанівець їхні лужні властивості, значно підвищує кислотні; відрив будь-якого протона пригнічує практично до нуля кислотні властивості, значно підсилюючи лужні. При цьому нацкислішою є іміногрупа, утворена приєднаним протоном, а найпротофільнішим – той атом, від якого відірвано протон. На основі отриманих результатів зроблено практично важливий висновок: взаємопідсилення двох міжмолекулярних водневих зв'язків має місце в тому і лише в. тому випадку, коли основа виступає одночасно донором і акцептором цих зв'язків. В інших випадках відбувається їхнє взаємне ослаблення. В світлі отриманих результатів по взаємовпливу (кооперативності) міжмолекулярних Н-зв'язків обговорюються квантов о хімічні засади самоасоціації Іт та Руг шляхом водневого зв'язування, а також уточнюються деталі фізико-хімічного механізму каталітичної активності серин-гістидинових естераз, зокрема хімотрипсину.
Related Papers
- → Remarkable fluorescence change based on the protonation–deprotonation control in organic crystals(2013)126 cited
- → Protonation/Deprotonation Reactions Triggered by Photoactivation of Photoactive Yellow Protein from Ectothiorhodospira halophila(1999)68 cited
- → The synthesis and photophysical studies of cyclometalated Pt(ii) complexes with C,N,N-ligands containing imidazolyl donors(2011)18 cited
- → Molecular Orbital Calculations of Diketo‐dipyridyl‐pyrrolopyrrole, Diketo and Dithioketo‐diphenyl‐pyrrolopyrrole on Protonation and Deprotonation(1993)8 cited
- → The Optimum pH of Oxidoreductases: A Comparison Between Experimental and Calculated pH Optimum(2002)2 cited